清洗冷卻塔可提升冷卻系統的性能，洗菌增長是冷卻塔污染的主要原因。武漢冷卻塔清洗程序應包括：包括消毒，清洗；包括所有潮濕表面的清洗；至少每6個月清洗冷卻塔一次。

在化學消毒和機械清洗工人提供正確的個人防護裝備（PPE），以保障他們暴露于清潔或消毒化學物質和水，可能含有軍團菌的。

工具包括：全長防護服，防水靴，防滲透手套，護目鏡，全部或半臉面具相結合的一種高效微粒空氣過濾器的至少一個第二類和化學過濾筒型深呼吸保護裝置。  為工人提供適當的設備，使他們能夠安全地訪問工廠和安全工作（如高空作業）。確保所有操作人員都能夠完成的任務。使用正確的關機程序。

切斷和分離出的熱負載的源（如冷卻器，過程工廠）。關斷和隔離冷卻塔/蒸發式冷凝器風扇。切斷吹式系統（清除）閥，關閉自動吹斷控制器（如果有的話），并設置為手動系統控制器。將冷卻水閥門打開。水循環泵所需要的循環水通過冷卻系統的各個領域（包括備用冷水機組、水泵、平衡線和死角）。